Son époux, Ptolémée IV Philopator est secondé par un Grec du nom de Sosibios qui avait déjà servi son père. Sur ses conseils ainsi que ceux de sa maîtresse Agathocléa, il fait assassiner sa mère Bérénice, son frère Magas ainsi que son oncle Lysimaque, épargnant Arsinoé qui devient ainsi sa complice.

Elle meurt assassinée en -204, un an après son mari, victime d’une conspiration préparée par son conseiller Agathocle et sa sœur, Agathocléa, première concubine du roi et perpétré par les favoris de son fils Ptolémée V, âgé de six ans.